使用模板网站不利于网站优化，主要就是对搜索引擎不友好，现在的搜索引擎对两个站出现一样的文章都会做出降权更何况是两个相似的网站呢?其次就是对公司形象的不重识，当客户在访问网站时打开您的网站发现您这个网站已经和很多网站相似，那么客户对您这个网站的印象会大大折扣。所以建议用户可以使用自助建站，但切不可把自助建站里的网站当独立网站进行推广。
一、自助建站和模板建站都是套用固定模板，风格模块等都固定，不能充分展示企业形象。网站就是一个企业的门面，网站做的漂亮，就算企业规模不大，但是给别人感觉也是一家比较有实力的企业。反之，如果网站做的不好，就算企业有一定实力，很多客户进入企业网站后，看到网站后也会觉得企业实力有限，从而丢失客户。所以，企业网页的设计是非常重要的，而要有一个好的网页设计，模板网站是无法实现的。
二、模板网站和自助建站制作出的网站无法得到一个好的搜索引擎排名，因为模板网站，在网上用同类模板制作的网站有很多，现在搜索引擎，特别是百度，对网站内容的要求要原创性。而模板网站，从网站的架构开始，就已经违背了百度对内容原创性的要求，这样做出来的网站，是很容易被百度降权的。那么降权是什么概念呢?降权就是百度虽然有收录企业网站，但是搜索任何关键字都没有排名，包括搜索公司名称。导致企业基本除了一些熟悉的朋友和内部人员懂得网址的可以看到外，其他客户基本都找不到。
三、模板网站的内容维护操作难度大。很多模板网站后台功能看似很强大，什么都可以修改，但是因为后台集中了大部分的网站建设功能，导致后台一般非网站建设专业人士，很难懂得操作，不利于客户自己更新网站内容。而定制网站的网站后台，一般都是由专业的程序人员进行一定的修改，删除了多余的功能，整个界面都是比较简单，就像玩qq空间一样。上传图片、修改内容，只需要点几下就可以完成。